MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC3

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018675	TA	3	6	767	772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018675	A	6	6	795	800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018675	T	8	8	853	860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018675	AGCAA	2	10	897	906	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018675	TGT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018675	AG	3	6	970	975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018675	AAAT	2	8	2062	2069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018675	T	7	7	2078	2084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018675	GT	3	6	2129	2134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018675	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018675	TTA	2	6	5034	5039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018675	TTG	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018675	TTTAT	2	10	5106	5115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018675	AAAT	2	8	5128	5135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018675	ATC	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018675	T	7	7	5176	5182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018675	T	6	6	5185	5190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018675	TTTAT	2	10	5194	5203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018675	TTA	2	6	5229	5234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018675	T	7	7	5268	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018675	T	6	6	5311	5316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018675	TAA	2	6	8930	8935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018675	TA	3	6	8960	8965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018675	TA	3	6	8974	8979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018675	TAT	2	6	8981	8986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018675	TAT	2	6	8994	8999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018675	ATT	2	6	9034	9039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018675	ATA	2	6	9049	9054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018675	AT	3	6	9101	9106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018675	ATAA	2	8	9113	9120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018675	TAT	2	6	9176	9181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018675	TAAAT	2	10	9193	9202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018675	TAT	2	6	9213	9218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018675	CCA	2	6	9230	9235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018675	TACA	2	8	9257	9264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018675	ACA	2	6	9297	9302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018675	TGT	2	6	9312	9317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018675	A	6	6	9439	9444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018675	ACT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018675	ACAA	2	8	9498	9505	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018675	GTA	2	6	9520	9525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018675	ATA	2	6	9610	9615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018675	T	7	7	9645	9651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018675	AGT	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018675	GACG	2	8	9719	9726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018675	TCT	2	6	9766	9771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018675	TCAA	2	8	9820	9827	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018675	CAA	2	6	9848	9853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018675	CTT	2	6	9854	9859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018675	GATTTA	2	12	9875	9886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018675	A	8	8	9895	9902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018675	CATAAT	2	12	9905	9916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018675	TGT	2	6	9939	9944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018675	CG	3	6	9961	9966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018675	TGG	2	6	9978	9983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018675	TTG	2	6	11077	11082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018675	ATA	2	6	11103	11108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018675	AGTT	2	8	11118	11125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018675	A	7	7	11129	11135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018675	T	6	6	11180	11185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018675	TCT	2	6	11187	11192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018675	GA	3	6	11201	11206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018675	A	7	7	11209	11215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018675	AAT	2	6	11330	11335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018675	T	6	6	11341	11346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018675	TTA	2	6	11351	11356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018675	TTTTG	2	10	11357	11366	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018675	AGT	2	6	11377	11382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018675	TGA	2	6	11412	11417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018675	ACT	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018675	GC	3	6	11479	11484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018675	T	6	6	11559	11564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018675	GTT	2	6	11620	11625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018675	TAAGT	2	10	11645	11654	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018675	T	6	6	11657	11662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018675	T	9	9	11665	11673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018675	TTG	2	6	11687	11692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018675	T	6	6	11704	11709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018675	GTAG	2	8	11758	11765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018675	TGT	2	6	12111	12116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018675	AAGCA	2	10	14518	14527	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018675	CTG	2	6	14566	14571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018675	CTG	2	6	14593	14598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018675	TGG	2	6	14608	14613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018675	C	6	6	14700	14705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_018675	G	7	7	14718	14724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018675	CTC	2	6	14755	14760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018675	A	7	7	14833	14839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018675	TAA	2	6	14842	14847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018675	GGA	2	6	16362	16367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018675	CA	3	6	16368	16373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018675	GAG	2	6	17652	17657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018675	ACA	2	6	18411	18416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018675	T	7	7	19539	19545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018675	ATC	2	6	20262	20267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018675	A	6	6	20302	20307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018675	TAGAA	2	10	22849	22858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018675	AGTTA	2	10	22867	22876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018675	GTG	2	6	22878	22883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018675	GGT	2	6	22906	22911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018675	TTA	2	6	23091	23096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018675	AGT	2	6	23146	23151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018675	ATG	2	6	23187	23192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018675	ATG	2	6	23199	23204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018675	ATTG	2	8	25689	25696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018675	T	7	7	27389	27395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018675	AAT	2	6	29171	29176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018675	T	6	6	29185	29190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018675	A	7	7	30316	30322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018675	A	7	7	30785	30791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018675	TAG	2	6	30859	30864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018675	TGC	2	6	30867	30872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018675	GT	3	6	30882	30887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018675	CACT	2	8	30891	30898	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018675	TTG	2	6	30925	30930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018675	TAC	2	6	30942	30947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018675	A	7	7	33393	33399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018675	GC	3	6	33400	33405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018675	TTC	2	6	38795	38800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018675	TAA	2	6	38847	38852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018675	T	6	6	38865	38870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018675	CCT	2	6	38877	38882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018675	AT	3	6	38940	38945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018675	TA	3	6	38946	38951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018675	A	7	7	38976	38982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018675	AAT	2	6	39010	39015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018675	T	6	6	39024	39029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018675	TCT	2	6	39926	39931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018675	CTT	2	6	39945	39950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018675	CGTC	2	8	39996	40003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018675	TTC	2	6	40019	40024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018675	CAA	2	6	40104	40109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018675	TGA	2	6	40111	40116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018675	ATA	2	6	40148	40153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018675	A	7	7	40155	40161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.